近5年来,医院共获科研项目373项,其中国家自然科学基金项目64项(重点项目1项),国家科技支撑计划项目3项,国家卫计委重大专项项目1项,发表SCI论文400余篇。据中国信息研究所统计数据显示,近十年来医院SCI、MEDLINE收录论文、累计被引用篇数和被引用次数连续多年排名全国儿童医院第一位。医院创办的国内唯一的国际性全英文儿科学专业期刊——World Journal of Pediatrics,影响因子最高达1.236,连续多年保持亚洲同类期刊第一,该期刊已取得国际和国内刊号,并获得了中国科技期刊国际影响力提升计划项目资助和“中国最具国际影响力学术期刊”称号。近五年来,浙大儿院获得宋庆龄儿科医学奖3项、中国首届妇幼健康科学技术二等奖2项,并连续三年获浙江省科技进步一等奖。